Pondok Madrasatul Qur'an adalah jenis pondok pesantren yang khusus fokus pada pengajaran dan pembelajaran Al-Qur'an. Di sini, para santri (murid) diberikan perhatian lebih dalam menghafal, memahami, dan mengkaji Al-Qur'an secara mendalam. Madrasatul Qur'an bertujuan untuk mencetak generasi yang mampu menghafal (hifz) Al-Qur'an dengan baik dan benar, serta memahami makna dan tafsirnya.

Biasanya, di Pondok Madrasatul Qur'an, santri menjalani program khusus untuk menghafal Al-Qur'an, dengan berbagai metode yang dirancang agar para santri dapat menghafal dengan lancar dan mengingatnya sepanjang hidup. Selain itu, beberapa pondok madrasatul Qur'an juga mengajarkan ilmu-ilmu agama lainnya, seperti fiqih, tafsir, dan ilmu tajwid, yang membantu santri dalam memahami Al-Qur'an secara menyeluruh.

Di banyak tempat, Pondok Madrasatul Qur'an menjadi tempat yang sangat dihargai karena perannya dalam melahirkan para penghafal Al-Qur'an (Hafiz) yang memiliki kedalaman pemahaman terhadap ajaran Islam.